转录组原始数据上传SRA,转录组注释上传到哪个数据库

转录组原始数据上传SRA,转录组注释上传到哪个数据库

选择原始数据上传的方式，数据较少就选网页上传，如果较多可以选择第二个，这里推荐Aspera方法上传数据注：网页上传选择第一个选项webbroser uplode; 点击选择文件直接上传即可；样本较少可选择网页上其储存的数据类型，既包括原始测序数据(raw sequencing data),也包括序列比对信息(alignment information)。许多杂志的论文发表，都要求作者将高通量测序数据在SRA 公开发布。下面就为大家介绍一下

?０? 下面分享一下转录组二代原始数据在SRA(https://submit.ncbi.nlm.nih/subs/sra/)的上传方法。第一步：NCBI账号申请&登录登录网址：https://ncbi.nlm.nih/,依次点击“SignSRA简介：SRA(Sequence Read Archieve)数据库是NCBI搭建的存放原始测序数据的平台。SRA能兼容不同测序平台的数据，比如Sanger测序、Illumina测序、PacBio测序等，所以无论是基因组

如何将转录组测序数据上传到SRA ⼀般上传数据到NCBI SRA的过程需要如下⼏步：1）收集整理原始测序数据⽂件；2）为需要上传的数据⽂件⽣成md5 校验码；3）注册NCBI账号；6）如何上传转录组数据到NCBI的SRA数据库第⼀步：打开NCBI主页，如下图第⼆步：选择Sequence Read Archive (SRA)，如图。SRA数是NCBI专门⽤于存储、显⽰、提取和分析⾼通量测

原始数据需要选择上传SRA 图3 选择上传SRA (三)创建新的submission,开始上传工作图4 创建新的submission (1)SUBMITTER,系统自动带出个人账号的信息，可以对信息进行修改图5 SUBMIT上传之前，首先需要准备两样必备品：原始数据与NCBI的账号。在小派这里做转录组的家银们，在您拿到的转录组结果中，有一个rawdata的文件夹，这里存放的就是可以直接上传的原始数据啦。Fastq是需要上