rip—qpcr内参,RIPqpcr结果计算

rip—qpcr内参,RIPqpcr结果计算

RIP(RNA免疫沉淀)拉出来的RNA理论上没有内参基因，是怎么算出%of input的呢？赞回应转发赞收藏只看楼主昨夜风吹2021-09-14 20:29:11 我记得sigma 公司有RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation),是研究细胞内RNA 与蛋白结合情况的技术，应用领域包括转录后调控研究、表观遗传调控，可以发现miRNA的调节靶点。RNA结合蛋白(RBP)

∪０∪ 采用RIP技术获取HeLa细胞中SF2蛋白相互作用的RNA,等比例加入外源酿酒酵母(BY4741)RNA,并以其β-actin作为内参基因，利用qPCR检测RIP富集SF2蛋白相互作用RNA的效率.结果显示，0RIP(RNA结合蛋白免疫沉淀)是研究体内RNA 与蛋白结合情况的技术，主要包括RIP-qPCR和RIP-seq两种；其中RIP-qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知RNA,RIP-seq用来筛选与目标蛋白结合的未知RNA。2、实

MeRIP-qPCR 是m6A-IP-qPCR 的另一种说法。所以从名称上我们就能发现，m6A-IP–qPCR 基本和常规的RIP–qPCR 相似。当然在讨论RIP–qPCR 之前，我们先来看看常规的RT-qPCR 科研产品基因表达产品分子互作产品抗体产品免疫沉淀/Pull down beads 其他产品抗体工程抗体测序抗体表达成功案例客户文章技术专题问题答疑新闻动态公司新闻

那么是不是m6A-IP–qPCR就真的没内参了呢？其实也不是！实际上我们会发现整个input充当了内参基因的概念，一个基因的甲基化水平是无法直接用RIP下来的RNA在做qPC(1)MeRIP-qPCR不需要内参来进行样本间的均一化矫正从结果的形式%(IP/Input)我们也可以看到，这个实验侧重看修饰的片段(IP样品qPCR结果)占总片段(Input样品qPCR结果)的比例，实验目的只是要得到这两

˙０˙ 一、RIP-qPCR实验步骤1、细胞抽提将细胞抽提液制备成相应浓度的蛋白质溶液。2、预处理添加RNase抑制剂以减少RNA降解。3、抗体结合RNA 将特定的抗体加入到经过预处理的细胞抽提RIP实验跑qpcr的结果应如何分析？文献都是写%Input,内参要如何参与计算？如题，小白很困惑，我看文献里IgG组的%Input很低，不知道是如何换算的；这个可以先换对数，后取百分比。