ssr测序,SSR类型统计图

ssr测序,SSR类型统计图

基因组DNA超声或酶切打断后，利用8种生物素标记的探针杂交捕获SSR序列，将文库富集后进行测序，测序平台为454 GS-FLX。该方法首先在模式生物意大利蜜蜂中进行流程优化，然后在其它13个摘要：SSR分子标记由于具有成本低廉、容易操作等特性，使其在分子标记辅助育种中广泛应用。目前高粱SSR标记多基于测序已经完成美国高粱品种BTX623基因组开发，在应用中筛选多态性标记的

本研究结果很好的证明了，与传统的仅仅依靠片段大小来进行评分和基因分型的方法相比，利用下一代测序技术进行SSR基因分型，可以获得更高水平基因多态性结果。SSR基因座测序是一种前瞻性方法，能够检测上海派森诺生物科技有限公司拥有国内第一台Roche 454 GS FLX+平台，利用其高读长的优势成功完成了SSR分子标记技术的研发，构建了自己的探针库，是国内首家采用高

SSR分析的原理及操作技术DNA分子标记技术类型以Southern杂交为基础的分子标记技术，限制性内切酶片段长度多态性标记RFLP以PCR为基础的分子标记技术表4、利用Tassel软件进行的椰子果实产量关联SSR标记分析可见，只要大家手上有好的实验材料，在记录统计好表型数据并且准确获得SSR基因分型信息后，就可以利用PowerMarker、Structure和Tassel这“三

通常来说，物种的SSR分子标记检测可以分为引物开发、引物筛选和样本批量检测三个步骤：(1) SSR引物开发很多物种并没有完成全基因组测序，导致基因组信息缺失。进行SSR研究时需要进行1)通过筛选文库、测序开发自己的SSR引物。2)通过核酸数据库查询，从已有序列中搜寻包括SSR的序列并设计引物。SSR分析实验的主要技术环节：提取DNA;PCR扩增；电泳及显色；电泳胶

SSR的开发可以依赖基因组DNA序列，也可以依赖由单链RNA (cDNA)合成的双链DNA,这取决于项目目标、未来的研究方案以及研究人员管理输出数据的能力。使用DNA直接测天昊生物自主研发的SSR分型新技术—SSRseq™,这种方法几乎克服了现存所有检测方法的不足，尤其适合对多SSR位点、超高深度的分型，准确度高，并且分辨率达到单碱基的水平，具体技术优势