SSR序列,snp和ssr检测的区别

SSR序列,snp和ssr检测的区别

“在植物基因组中存在一些特定的区间片段——SSR序列，它们在同一物种中普遍存在，但在不同品种中却高度特异，且不复杂、易鉴定，是区分不同品种的关键位点。这些位点的组合排列就相当于品种的DNA根据重复序列的重复单位的长度，可将串联重复序列分为卫星DNA、微卫星DNA、小卫星DNA等。微卫星DNA又叫简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),指的是基因组中由1-6个核苷

全染色体查找SSR *新建一个全新文件夹把misa.ini、misa.pl、misa_multiprocessing.py、还有基因组fasta放进去* 你还需要安装几个生信常用工具，建议conda省时省4. SSR标记特点：l 检测到的一般是一个单一的多等位基因位点。l 共显性遗传，符合孟德尔遗传规律，所以可以用来鉴别杂合子和纯合子。l 数量丰富，覆盖整个基因组，而且分布均匀。l SSR序列的两侧序

ˋ＾ˊ〉-# SSR 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,也可称为SSRP(Simple Sequence Repeat Polymorphisms),STMS (Sequence-tagged microsatellites)。其串联重复的核心序列为1-6 bp,其中最常见是双核昔酸重复，即(Cssr具有以下一些优点：l)一般检测到的是一个单一的多等位基因位点；⑵微卫星呈共显性遗传，故可鉴别杂合子和纯合子；⑶所需dna量少。显然，在采用ssr技术分析微卫

SSR的其他含义如上所述，SSR具有其他含义。请注意下面列出了其他五个含义。您可以单击左侧的链接以查看每个定义的详细信息，包括英语和您的本地语言的定义。在英语中的定义：Simple Sequence Repea简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)在真核生物基因组中广泛存在，一般是以1-6bp组成较低程度的重复序列，主要以2-3个核苷酸为重复单位如(GA)n、AC)n和(G

SSR标记实验步骤SSR简单序列重复标记可以用于：用微卫星区域特定顺序设计成对引物，通过PCR技术，经聚丙烯酰胺凝胶电泳，即可显示SSR位点在不同个体间的多态性。SSR标记实验步SSR是Simple Sequence Repeat的缩写，意思是简单重复序列标记，SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，或称微卫星