基因组序列微卫星,微卫星重复序列

微卫星序列 2023-11-28 23:14 694 墨鱼

微卫星序列

基因组序列微卫星,微卫星重复序列

∩﹏∩ DIYABC v2.0允许分析统计上独立的SNP标记，除了微卫星和DNA序列数据。与其他类型的标记相比，SNP位点的突变率较低，因此该位点的多态性是在整个群体基因树中发生微卫星不稳定性(MSI)是指由于基因复制错误引起基因组中重复序列次数的增加或丢失，导致微卫星片段长度发生了缩短或延长。一般情况下，这种错误会被DNA 的错配修复系统(Mismatch Repai

微卫星出现在生物体基因组的数千个位置。它们比DNA 的其他区域具有更高的突变率，从而导致高遗传多样性。微卫星通常被法医遗传学家和遗传系谱学称为短串联重复序列(STR),或被植微卫星(microsatellite)也叫短串联重复序列(short tandem repeat, STR) 或简单重复序列(simple sequence repeats)，是由几个(多为2~4个)碱基对作为核心单位，串联

二、微卫星标记技术的一般流程微卫星分析的关键在于开发基因组中某个微卫星两侧的引物序列。如果有现成的微卫星引物，在PCR扩增后，即可利用电泳技术进行分析。1)MSS: Microsatellite Stability,微卫星稳定性。即微卫星不发生突变。2)MSI-L: Low-frequency MSI,低频微卫星不稳定性，即患者微卫星突变检测出的频率低。40%的微卫星位点发生

微卫星不稳定性(MSI)是大基因组不稳定性的重要指标，与包括林奇综合征在内的许多遗传疾病有关。MSI状态也是多种癌症类型(如结直肠癌和子宫内膜癌)良好生存的独立预后因素，还提示化疗以微卫星发生频率的改变为特征的基因组不稳定性被称为MSI。微卫星的突变率很高，MSI与结直肠癌、胃癌等肿瘤的关系也十分密切。DNA复制时，微卫星序列容易在DNA聚合酶的作用下发生滑

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