SSR标记01型与bp型,SNP标记是什么意思

SSR标记01型与bp型,SNP标记是什么意思

SNP:单点多态，SNP标记纪录的是一个等位位点上的不同碱基(编码一般是binary的，除非位点不是biallele的) SSR不可能位于功能基因的内部(根据其结构特征，功能基因2. 1. 1 R FL P s 标记R FL P s 标记是由于不同基因型中内切酶位点的碱基插入，缺失，重组或突变，利用限制性内切酶消化基因组DNA 时，会产生大小不同的DNA 片段，电泳后

5)加入3μl 已由loading buffer 处理过的样品DNA,每块板子可点1-3 个Marker,55W 恒定功率电泳1.5h,至第一条Loading buffer 指示带(二甲苯青带，约相当于260bp 双链DNA)跑至SSR标记原理简单序列重复(single sequence repeat)简称SSR s)或微卫星(m icrosatellite)序列大量地存在于大多数真核生物及部分原核生物基因组的非编码区和编码区中，由串联的1- 6

试验中可选择合适的LIZ,用LIZ校正等位基因峰值，SSR分子标记属于短串联重复，DNA 片段较短，如玉米种子真实性检测SSR 分子标记等位基因位于100～430bp 之间[4],可选用LIZ500 作为分子图1 SSR标记RM337和RM5414的等位基因，箭头所指带型代表不同的等位基因2. SSR标记的基本原理：尽管微卫星DNA分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守单拷贝序列，因此可以根据这两端的序

ˋωˊ SSR 标记数量丰富，覆盖整个基因组，而且分布均匀，多态性高，呈共显性遗传，重复性好，操作简便，是依据法国甘蓝型油菜Darmor-bzh参考序列，在C03染色体52—55 Mb区间运用MISA和Primer3结合设计SSR引物(表2)。筛选到6个能明显区分F2极端黄花单株和极端白花单株的SSR标记(图4)。6个

SSR 真核生物的基因组中散布着大量的串联重复序列，其中，2-4 个bp 的微卫星序列(Microsatellite 或叫简单序列重复SSR:Simple Sequence Repeats) 具有高度多导致比等位基因1长6bp,如果通过传统技术就会认为这个SSR分子标记是差2个GAC重复单元的2种分型，而SSRseq技术分析则认为2条序列GAC的重复单元数是一样的。