SSR图带结果分析,SSR原理及使用

SSR图带结果分析,SSR原理及使用

用到576对SSR引物对子代进行PCR分析，重复三次为避免抽样误差，进行了300多个子代个体的取样原理：对于某一基因位点，如双亲基因型都为杂合子ab(SSR电泳图中为！SSR分析的原理及操作技术DNA分子标记技术类型以Southern杂交为基础的分子标记技术：限制性内切酶片段长度多态性标记(RFLP) 以PCR为基础的分子标记技术：随

2、文库构建结果分析由图2可知，图中的折线无较大波动，说明文库随机性较好，在读序不同位置的碱基组成分布比较均匀，可以保证后续分析的数据质量。3、SSR位点分布结果使用MISA检测序可根据地区，聚类，structure 的种群分类来做此分析，并比较不同分类下的遗传差异，种群内外变异差异。1)GenAlex中AMOVA分析需要确定以下参数AMOVA参数对于共显性数据有以下三个选

?▂? 求高人指点一下得到以上数据的操作方法，谢谢，不胜感激不是群体偏离HWE,是位点采用淀粉凝胶电泳方法，分析了9 个酶系统，分析结果表明，居群的遗传变异处于较低主成分的结果存储在li中还是认为的分个组，然后做散点图mydf1.pca.scores$Pop<-ifelse(mydf1.pca.scores$Axis1>0,"pop1","pop2") library(ggplot2) ggplot(mydf1.pca.scores,aes(x=

图3 苦荞ssr基序长度分布范围fig. 3 distribution range of ssr motif length of tartary buckwheat 2.2 苦荞基因组ssr引物的多态性检测2.2.1 不同ssr引物类型分析按照ssr在基因基于SSR数据的群体结构分析和DeltaK值可视化1.ssr做群体结构数据准备1.1数据转换。1.2原始数据是不符合structure的格式要求的，分享给大家我的python脚本做数据格式转换。cat

SSR分析的原理及操作技术▪高温变性：双链DNA模板加热变性成单链；▪低温退火：在低温下引物与单链DNA互补配对；退火温度针对不同的引物差别较大，退火温度过低，极易形成非特异扩增，而退火温图1、群体遗传关系的聚类分析结果图2、利用Structure软件对椰子群体进行遗传结构分析表4、利用Tassel软件进行的椰子果实产量关联SSR标记分析可见，只要大家手上有好的实验材料，在记录统计好表型